虽然高新技术企业认定成功后就可以坐等享受优惠，但如果认定后的管理工作不重视或不到位，还是会有被“摘帽”甚至追缴已享优惠的风险，被取消高新技术企业资格的企业，认定机构在5年内不再受理该企业的认定申请。 2. 发生重大安全、重大质量事故或有严重环境违法行为的；3. 未按期报告与认定条件有关重大变化情况，或累计两年未填报年度发展情况报表的。具体来说有以下几点：
1. 没有建立研发费用专账管理，或者专账管理不达标。5. 年报、季报填写的数据不符合高新技术企业体系要求。
2. 季报、年报填写的数据要符合高新技术企业体系要求；
- 每年3月底在火炬中心业务办理平台完成年度火炬计划统计报表的填写；
- 每年5月底前在火炬中心业务办理平台完成高企年度统计数据报送；
- 符合科技型中小企业资质的企业，在每年的9月份之前在火炬中心业务办理平台完成科小的申报；
研发活动R&D统计，每年在国家统计局网站填报当年研发项目及费用情况，完成统计数据填报。包括：研发立项管理、研发费用管理、研发创新团队建设管理、知识产权管理。每年初按照上一年营业额以及当年营业规模进行预测，结合高企研发费用要求以及企业研发费预算进行规划研发项目，包括项目数、项目名称、时间、预算等。并且完善项目流程管理，包括项目决议、审批、结题验收等，确保项目管理规范化；年终对项目费用进行归集核算统计，对项目实施进行阶段性或者完工总结。建立研发科目，定义规范和研发行为，明确研发费用范围和归集要求，并费用按照项目、费用类别进行归集，确保研发过程产生的费用准确、完整归集。日常过程中将研发费用直接归集到研发科目，通过每月度或季度进行统计研发费及营业额的比例情况以及不同类别的研发费的比例情况，确保费用合理。企业科技人员是指直接从事研发和相关技术创新活动，以及专门从事上述活动的管理和提供直接技术服务的，累计实际工作时间在183天以上的人员，上述科技人员要占总人数的10%以上，并且将上述人员费用计入研发费用的人工成本。每年按照研发成果进行知识产权的申请，实现技术成果的转化应用及技术成果保护管理，提升企业的技术水平，提升企业无形竞争力。按照目前公司的规模，平均每年申请专利3-5件，最低不少于2件。知识产权做好战略化布局，并且也需要做好规划，关注知识产权核心技术与公司主营产品的关联性。每年做好高新技术产品的认定，规划每年做3-5件高新技术产品，对产品占比、产品名称、技术水平、市场竞争力、市场占有率等方面做全面了解，确保其具备代表性，并且也要考虑高企到期后的重新认定工作。每年执行研究开发费用的加计扣除项目，其需要对研发立项、费用准确核算提出要求。税务方面：是否严格遵守税务管理要求，避免出现偷税漏税问题；环保方面：是否存在环评风险，是否存在严重环境违法行为。
